Για λόγους δημοσίου συμφέροντος αλλά και για λόγους προστασίας των ωφελουμένων, το Συμβούλιο της Επικρατείας (ΣτΕ) απέρριψε τις προσφυγές κατά της προσωρινής διοίκησης της Κιβωτού του Κόσμου και έθεσε σφραγίδα νομιμότητας στις υπουργικές αποφάσεις, με τις οποίες διορίστηκε η προσωρινή διοίκησή της και στη συνέχεια παρατάθηκε η θητεία της.
Η υπόθεση έφτασε μέχρι το Ανώτατο Ακυρωτικό Δικαστήριο μετά την προσφυγή της πρεσβυτέρας Σταματίας Γεωργαντή και της μητέρας του ιδρυτή της Κιβωτού, πατέρα Αντώνιου, που υπήρξαν τα μοναδικά μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου.
Οι προσφεύγοντες ζητούσαν να ακυρωθούν οι υπουργικές αποφάσεις που συνδέονταν με τον ορισμό της προσωρινής διοίκησης και την παράταση της θητείας της, αλλά οι ανώτατοι δικαστές απέρριψαν ως αβάσιμους όλους τους ισχυρισμούς που προβλήθηκαν και τις έκριναν «νόμιμες και επαρκώς αιτιολογημένες».
Το σκεπτικό του ΣτΕ για την απόρριψη της προσφυγής
Ειδικότερα, το Δ’ Τμήμα του ΣτΕ, υπό την προεδρία της αντιπροέδρου του Ανωτάτου Δικαστηρίου Σπυριδούλας Χρυσικοπούλου, στην απόφασή του, μεταξύ άλλων, αναφέρει ότι «το μέτρο του ορισμού προσωρινής διοίκησης, το οποίο συνιστά επέμβαση στην αυτονομία των νομικών προσώπων, επιβάλλεται για λόγους δημοσίου συμφέροντος, συνιστάμενους στη διασφάλιση του απαιτούμενου επιπέδου περίθαλψης και μεταχείρισης των ωφελουμένων και ανάγεται στο πλαίσιο της κρατικής εποπτείας επί των φορέων αυτών και της συνταγματικής υποχρέωσης του κράτους να λαμβάνει τα απαιτούμενα μέτρα για την προστασία της παιδικής ηλικίας και της νεότητας».
Με βάση το σκεπτικό του δικαστηρίου, η παράταση της προσωρινής διοίκησης αποσκοπεί «στην ικανοποίηση του συμφέροντος τόσο των ωφελούμενων προσώπων όσο και του ίδιου του φορέα, προκειμένου να διασφαλιστεί η ομαλή λειτουργία του, έως ότου οι συνθήκες επιτρέψουν την ανάδειξη νέας αξιόπιστης διοίκησης από τα καταστατικά του όργανα» – εξάλλου, αυτό είναι μέτρο «εξαιρετικού προσωρινού χαρακτήρα».
 απέρριψε τις προσφυγές){kind=link}